يتكون هيكل الجمعية التنظيمي من /9/ إدارات تتبع للمدير التنفيذي،
    وتتألف كل إدارة من عدة أقسام ومكاتب حسب الوظائف المطلوبة منها؛ وهذه الإدارات تشمل:

    1. إدارة الشؤون الإدارية.
    2. إدارة الموارد البشرية.
    3. إدارة الشؤون المالية.
    4. إدارة برنامج المساعدات.
    5. الإدارة القانونية والعقارية.

    6. إدارة التسويق والعلاقات العامة.
    7. إدارة المشاريع وتطوير الأعمال.
    8. إدارة دار الرحمة للإناث.
    9. إدارة دار الرحمة للذكور.